Село Дуба-Юрт было основано в 1859 году и названо в честь наиба имама Шамиля — Дубы Вашиндаройского.
История
Земля до границ с селом Новые Атаги, на которой располагается ныне село Дуба-Юрт, была выделена царской администрацией в собственность Дубе за службу. В период Кавказской войны в рапортах царских генералов и в переписке наибов Шамиля село не упоминалось. В отчёте генерала Евдокимова об экспедиции в Аргунское ущелье с 15 января по 18 апреля 1858 года, при прохождении военной колонны по территории села Дуба-Юрт не упоминаются какие-либо строения.
«…В тишине и безмолвии, мы быстро шли по правой стороне реки Аргуна, без всякой дороги, и как при жестоком морозе глубокий снег до чрезвычайности затруднял движение пехоты, то, для облегчения такового, впереди колонн была выслана кавалерия, растоптавшая твердый снег. Перед светом, мы добрались до башни, устроенной на правой стороне реки Аргуна, против крепости Воздвиженской, где, сделав непродолжительный привал, тронулись дальше, по направлению к Аргунскому ущелью. Здесь только мы узнали цель нашего движения. По левой сторонe реки Аргуна, вместе с нами, и по тому же направлению, из крепости Воздвиженской, тронулась третья колонна, под личным начальством генерал-лейтенанта Евдокимова. Подходя к самым воротам ущелья, по огромному чинарному лесу, изнуренные бессонницею, а больше всего снеговой дорогой, которая лесом становилась ещё труднее, мы пришли почти в изнеможение…»
При выборе места для основания села Дуба долго не мог определиться, так как все более-менее пригодные для основания села земли имели названия раннее разрушенных в ходе Кавказской войны сёл (чечен. Оьзиг-Юрт, Темболт-Эвла, Муьрг-Эвла, Домбин-Юрт и т.д.), а он желал основать село со своим именем. Наконец, его выбор пал на то место (исторический центр села), на котором ныне располагается центральная мечеть. Место это у входа в Аргунское ущелье имело довольно неприглядный вид, продувалось частыми сильными ветрами и у населения близлежащих сёл не пользовалось уважением, имело очень влажный сырой климат, так как местность была заболочена протекавшими многочисленными родниками. Но выбор был сделан. Привлеченные Дубой жители окрестных сёл, живших в гораздо лучших климатических условиях, и представители ряда горных обществ, веками страдавшие из-за нехватки земли, за плату и за возможность поселиться на осушенных землях, прорыли канал в сторону реки Аргун и, сбросив воды разлившихся родников в реку, осушили центральную часть нынешней территории села. Затем, после возникшей с жителями села кровной мести, потомки Дубы переселились в СаIди-кIотар и поныне живут там.
Во время Кавказской войны, по указанию генерал-лейтенанта Фрейтага, желавшего наказать наиба Дубу, аул Дуба-Юрт уничтожен.
С 1944 по 1958 года, в период депортации чеченцев и ингушей и упразднения Чечено-Ингушской АССР, село носило название — Родниковое
